GOS2基因靶向甲基化測(cè)序確定了一種快速?gòu)?fù)發(fā)、常規(guī)致死的腎上腺皮質(zhì)*亞型

Targeted Assessment of G0S2

Methylation Identifies a Rapidly Recurrent, Routinely Fatal Molecular Subtype

of Adrenocortical Carcinoma. Clin Cancer Res. 2019; 25(11):3276-3288.

(IF= 10.199)

研究者分析了ACC-TCGA數(shù)據(jù)，在114例腎上腺皮質(zhì)**的**隊(duì)列中鑒定了一個(gè)在CIMP高ACC中***被高甲基化并沉默的基因G0S2，并通過(guò)高通量BSP得到驗(yàn)證。G0S2基因CpG島高甲基化**預(yù)測(cè)不良臨床后果，是ACC快速?gòu)?fù)發(fā)或致死的標(biāo)志。評(píng)估G0S2甲基化對(duì)臨床決策是直接可行的，并有助于對(duì)侵襲性ACC進(jìn)行有效輔助***。 基于高通量測(cè)序平臺(tái)的甲基化圖譜分析。江蘇Chip-seq技術(shù)服務(wù)專業(yè)服務(wù)

    2019國(guó)自然基金解析—甲基化研究專題。從生命科學(xué)部和醫(yī)學(xué)科學(xué)部總體來(lái)看：2019年度，生命科學(xué)部獲自然科學(xué)基金委批準(zhǔn)資助6478項(xiàng)（不含杰出青年基金項(xiàng)目），批準(zhǔn)資助金額共計(jì)，單項(xiàng)平均資助金額。2019年度，醫(yī)學(xué)科學(xué)部共批資助10138項(xiàng)（不含杰出青年基金項(xiàng)目），批準(zhǔn)資助金額共計(jì)，單項(xiàng)平均資助金額。從甲基化研究方向來(lái)看，與甲基化研究相關(guān)的項(xiàng)目總數(shù)達(dá)283項(xiàng)，項(xiàng)目總金額超過(guò)12669萬(wàn)元。其中生命科學(xué)部項(xiàng)目總數(shù)62項(xiàng)，項(xiàng)目金額3235萬(wàn)元，醫(yī)學(xué)科學(xué)部項(xiàng)目總數(shù)221項(xiàng)，項(xiàng)目金額9434萬(wàn)元。從2011-2019年甲基化研究方向的項(xiàng)目金額和項(xiàng)目數(shù)目分析，整體呈上升趨勢(shì)；從醫(yī)學(xué)科學(xué)部來(lái)看，甲基化研究項(xiàng)目獲批數(shù)量221項(xiàng)，項(xiàng)目金額達(dá)到9434萬(wàn)，較之2018年度項(xiàng)目獲批金額（7166萬(wàn)元）上升趨勢(shì)尤為明顯，可以看出，甲基化研究日益成為國(guó)自然的研究熱點(diǎn)。 北京TBS技術(shù)服務(wù)口碑推薦芯片平臺(tái)作為目前比較成熟的篩選工具。

    cfDNABS-Seq送樣要求一、送樣類型分離好的血漿二、保存方式分離后的血漿，用ml離心管分裝，例如：1ml/管；放-20℃冰箱中保存（短暫保存，1-2周）；放-80℃冰箱中長(zhǎng)期保存(1年以內(nèi))；保存期間不能凍融。三、運(yùn)輸條件干冰運(yùn)輸：順豐陸運(yùn)（3-4天時(shí)間），夏季10-15公斤干冰；秋冬季10公斤干冰四、抽血要求1、使用Streck**管（不建議使用普通的EDTA-鈉抗凝管），采集10ml外周靜脈血（客戶沒(méi)有Streck**管，公司配送）；2、室溫或者放置4℃冰箱中半小時(shí)以上，不超過(guò)8小時(shí)，進(jìn)行血漿分離步驟五、血漿分離步驟1、4℃條件下以1600g離心10min，離心后將上清（血漿）分裝到2、4℃條件下以16000g離心10min去除殘余細(xì)胞，將上清移入新的離心管中，每管分裝1ml;3、血漿樣本存放于-80℃冰箱中保存;使用干冰運(yùn)輸,提取之前不能凍融。備注1：血漿分離在4℃條件進(jìn)行，如果客戶沒(méi)有冷凍離心機(jī)，也可以在室溫條件下進(jìn)行；備注2：離心后取血漿上清，避免吸取白細(xì)胞；通常10ml全血可以獲得4-5ml血漿。

DNA甲基化異常用于甲狀腺結(jié)節(jié)診斷

Identification of

Tissue-Specific DNA Methylation Signatures for Thyroid Nodule Diagnostics. Clin

Cancer Res. 2019;15;25(2):544-551 (IF=

10.199)

惡性結(jié)節(jié)和良性結(jié)節(jié)常常難以診斷。本課題通過(guò)RRBS檢測(cè)了109個(gè)甲狀腺組織的DNA甲基化，發(fā)現(xiàn)*旁、良性結(jié)節(jié)和*組織之間存在***差異，并在65個(gè)甲狀腺結(jié)節(jié)的回顧性隊(duì)列樣本中得到驗(yàn)證。這些組織特異性DMR與活性增強(qiáng)子和**相關(guān)基因密切相關(guān)，表明DNA甲基化為甲狀腺結(jié)節(jié)提供準(zhǔn)確的診斷。 RRBS用于人、哺乳動(dòng)物及魚類方向的高水平甲基化研究。

    DNA羥甲基化(5hmC)是被認(rèn)為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基。Bisulfite-Seq并不能區(qū)分甲基化(5mC)和羥甲基化(5hmC)，實(shí)際上是5mC和5hmC兩種修飾的混合信號(hào)，而通過(guò)氧化亞硫酸鹽測(cè)序(oxidativebisulfitesequencing,oxBS-Seq)，先將5hmC氧化為甲?；揎?5fC)，進(jìn)而被亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換為堿基U，實(shí)現(xiàn)DNA甲基化的精細(xì)檢測(cè)。而同時(shí)對(duì)樣本進(jìn)行BS-Seq和oxBS-Seq測(cè)序則可實(shí)現(xiàn)對(duì)5hmC全基因組，單堿基分辨率的檢測(cè)，是羥甲基化檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn)方案。(12):1730-1741.(IF=)作者利用全基因組氧化-亞硫酸鹽測(cè)序(WGBS/oxWGBS)得到了肝臟和肺以及配對(duì)**組織的全基因組DNA甲基化和羥甲基化圖譜。在活躍的基因中，5hmC在CpGIslandshore中呈***富集狀態(tài)，而在CpGIsland中則呈稀缺狀態(tài)。對(duì)啟動(dòng)子、基因體和轉(zhuǎn)錄終止區(qū)域的羥甲基化分析，羥甲基化與基因表達(dá)有很強(qiáng)的正相關(guān)，這表明5hmC是活躍基因的標(biāo)記，并且可以在由DNA去甲基化調(diào)節(jié)的基因表達(dá)中發(fā)揮作用。 DNA甲基化作為表觀遺傳學(xué)研究的重要范疇。浙江RRBS技術(shù)服務(wù)專業(yè)服務(wù)

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DNA甲基化作為表觀遺傳學(xué)研究的重要范疇，已經(jīng)越來(lái)越受到研究者的關(guān)注。近些年來(lái)，隨著DNA甲基化與組蛋白甲基化的聯(lián)合作用機(jī)制、RNA干擾機(jī)制及去甲基化機(jī)制的發(fā)現(xiàn)，使得DNA甲基化研究受到***關(guān)注，從醫(yī)學(xué)領(lǐng)域擴(kuò)展到動(dòng)植物研究當(dāng)中，同時(shí)在研究方法上也取得了很大的突破?，F(xiàn)在用于DNA甲基化檢測(cè)的方法大概有十多種，從應(yīng)用上來(lái)分，大致可以分成兩類：全基因組甲基化分析及特異位點(diǎn)甲基化檢測(cè)。下面，我們就這兩大類檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行分析比較，以便于在實(shí)際的科研工作中進(jìn)行選擇。江蘇Chip-seq技術(shù)服務(wù)專業(yè)服務(wù)