相比于上述手段更為有效的策略是針對**相關*基因啟動子低甲基化而進行的靶向甲基化***,包括DNA和RNA介導的甲基化***。1)DNA介導的DNA甲基化:DNMT1**適底物為帶復制叉樣結構的半甲基化DNA,據(jù)此Yao等設計了一段22nt的甲基化脫氧寡核苷酸...
芯片平臺作為目前比較成熟的篩選工具,已經(jīng)在很多領域有了相應的應用。多家芯片公司在DNA甲基化這塊兒有了相應的產(chǎn)品提供,其中應用**為***的就Agilent平臺和Illumina平臺,相應的產(chǎn)品包括Agilent Human CpG Island Microa...
industryTemplate云生物提供甲基化服務。陜西RRBSDNA甲基化經(jīng)驗豐富羥甲基化DNA免疫沉淀測序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通過5hmC特異性抗體...
exoRBase由云生物平臺協(xié)助復旦大學上海**研究所黃勝林研究員團隊構建,該數(shù)據(jù)庫于2018年1月發(fā)表在NucleicAcidsResearch雜志,文章題為:exoRBase:adatabaseofcircRNA,lncRNAandmRNAin...
南五味子含有17個正向重復序列,16個回文重復序列和25個串聯(lián)重復序列。五味子包含30個正向重復序列,13個回文重復和25個串聯(lián)重復。而八角茴香含有8個正向重復序列,21個回文重復和32個串聯(lián)重復。長度為30-40bp的重復**常見的(平均%),切...
DNA甲基化修飾類型。5mc是表觀遺傳**重要的一種修飾,***存在于植物、動物等真核生物基因組中,被譽為“第五堿基”;5hmc是***發(fā)現(xiàn)的一種修飾堿基,成為哺乳動物的“第六堿基”;6mA在細菌、藻類及動植物基因組中存在。1992年,F(xiàn)romme...
當前位置:首頁>商城導航>immunetherapy免疫***收藏|分享immunetherapy免疫***價格:¥:標準套餐高級套餐購買數(shù)量:加入購物車立即購買產(chǎn)品詳情產(chǎn)品評論(0)immunetherapy免疫療法免疫療法是指利用人體自身免疫系...
亞硫酸氫鹽測序PCR(BSP) 這種方法一度被認為是DNA甲基化分析的金標準。它的過程如下:經(jīng)過亞硫酸氫鹽處理后,設計引物進行PCR擴增目的片段,并對PCR產(chǎn)物進行克隆測序,將序列與未經(jīng)處理的序列進行比較,判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化。這種方...
ATAC-seq(AssayforTransposase-AccessibleChromatinwithhighthroughputsequencing)是使用高通量測序對Tn5轉座酶可接近的核染色質(zhì)區(qū)域進行測序分析的一種研究技術;該技術由美國斯坦...
DNA甲基化作為表觀遺傳學研究的重要范疇,已經(jīng)越來越受到研究者的關注。近些年來,隨著DNA甲基化與組蛋白甲基化的聯(lián)合作用機制、RNA干擾機制及去甲基化機制的發(fā)現(xiàn),使得DNA甲基化研究受到***關注,從醫(yī)學領域擴展到動植物研究當中,同時在研究方法上也取得了很大的...
甲基化是表觀修飾的重要部分,DNA甲基化可以引起DNA構象、穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而影響基因表達。DNA鏈中含有很多CpG結構,雙鏈DNACpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲基化,基因組中60~90%的CpG都被甲基化,未甲...
目前,外泌體研究主要集中在以下幾個方向:開發(fā)疾病診斷和預后標志物揭示疾病發(fā)病機制作為藥物載體,實現(xiàn)靶向給藥作為疾病***的靶點參與免疫反應調(diào)控。外泌體蛋白質(zhì)組學服務:云生物根據(jù)主流外泌體研究策略,開發(fā)了一套完整的外泌體蛋白質(zhì)組學研究技術服務體系。提...
Chip-Seq 是指通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DN**段,并對其進行純化和文庫構建;然后對富集得到的DN**段進行高通量測序,通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉錄因子等互...
血清甲基化用于乳腺*轉移早期篩查 Methylation patterns in serum DNA for early identification of disseminated breast cancer. Genome Med. ...
安捷倫公司芯片平臺因其強大的eArray探針設計平臺,可以進行芯片的定制。在甲基化領域同樣適用。合作伙伴利用Agilent芯片平臺設計了一款專門針對**啟動子區(qū)域CpG島的甲基化芯片。絕大多數(shù)基因是針對基因的啟動子區(qū)域的CpG島設計探針。這款芯片上一共有416...
ssGSEA(single sample GSEA)主要針對單樣本無法做GSEA而提出的一種實現(xiàn)方法,原理上與GSEA是類似的。ssGSEA根據(jù)表達譜文件計算每個基因的rank值,再進行后續(xù)的統(tǒng)計分析。通過這個方法,我們可以得到每個樣本的免疫細胞或者免疫功...
PPImodule蛋白質(zhì)互作蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-proteininteraction,PPI)是指兩個或兩個以上的蛋白質(zhì)分子通過非共價鍵形成蛋白質(zhì)復合體(proteincomplex)的過程。PPImodule是指共表達蛋白模塊...
DNA甲基化修飾類型。5mc是表觀遺傳**重要的一種修飾,***存在于植物、動物等真核生物基因組中,被譽為“第五堿基”;5hmc是***發(fā)現(xiàn)的一種修飾堿基,成為哺乳動物的“第六堿基”;6mA在細菌、藻類及動植物基因組中存在。1992年,F(xiàn)romme...
使用IlluminaHiseq測序平臺對樣品進行測序,產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)(RawData)存在一定比例低質(zhì)量數(shù)據(jù),為了使得后續(xù)分析的結果更加準確可靠,會對原始的測序數(shù)據(jù)進行如下處理:1)去除reads中的adapter序列;2)剪切前去除5’端含有非A...
Microenvironment-inducedPTENlossbyexosomalmicroRNAprimesbrainmetastasisoutgrowth。思路:3.那么星形膠質(zhì)細胞內(nèi)的miR-19a怎么跑到**細胞那兒的呢? 作者就在m...
QuantSeq FWD UMI第二連合成模塊(Illumina, Read 1):UMI模塊含6個堿基長的**分子標簽(UMIs)對單個轉錄本進行**標記,在Read 1開始的時候就讀出來。模塊中包含UMI第二鏈合成Mix(USS),代替了QuantSe...
發(fā)育基因的表觀突變是養(yǎng)殖歐洲鱸魚開始馴化的基礎 Epimutations in developmental genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bas...
ssGSEA基本原理 對于一個基因表達矩陣,ssGSEA首先對樣本的所有基因的表達水平進行排序獲得其在所有基因中的秩次rank。然后對于輸入的基因集,從基因集中尋找表達數(shù)據(jù)里存在的基因并計數(shù),并將這些基因的表達水平求和。接著基于上述求值,計算通路中每...
血清甲基化用于乳腺*轉移早期篩查 Methylation patterns in serum DNA for early identification of disseminated breast cancer. Genome Med. ...